Component | AQ0402A | AQ0402B | AQ0402C | AQ0402D |
一步法RT-qPCR 2×SuperMi(Taqman) | 1ml | 1ml×5 | 5ml×4 | 5ml×10 |
Nuclease free Water | 1ml | 5ml | 5ml×4 | 5ml×10 |
產品說明:
本產品一步法RT-qPCR 2×SuperMix(Taqman)用于RNA分子的定量分析,由于采用Taqman探針進行定量,消除了引物二聚體和非特異性擴增產物帶來的假陽性誤差。本產品包含MMLV RTase2.0、RNase Inhibitor、熱啟動型Taq DNA聚合酶、dNTPs和優化的反應緩沖液,濃度為2×。RT-qPCR 反應時,只需加入RNA模板、引物和DEPC處理水,使2×SuperMix溶液的濃度為1×即可進行反應。RNA分樣本類型包括總RNA、mRNA、核糖體RNA、tRNA等。核心組分之一MMLV RTase2.0經基因工程改造,熱穩定性顯著提高,可以耐受55-60度,使得反轉錄反應可以在50-55度進行,從而消除了RNA二級結構對反轉錄的抑制作用。Buffer專門針對RT-qPCR進行了優化,MMLV RTase和Taq DNA聚合酶在該Buffer中均有較高活性,且Taqman探針釋放信號高,非常適合于Taqman探針型一步法RT-qPCR。
特點:
? 一步法減少RT-qPCR操作時間。
? 避免因多步操作帶來的污染。
? RNA片段的定量 (≤3 kb)。
? 熱啟動Taq酶,非特異性擴增導致的假陽性信號低,擴增效率高、穩定性好。
? 采用Taqman探針進行定量,消除了引物二聚體和非特異性擴增產物帶來的假陽性。
? MMLV RTase2.0可以在50-55度反轉錄,從而消除了RNA二級結構對反轉錄的抑制作用。
適用范圍:
RNA樣品(mRNA、rRNA等)的RT-qPCR定量,Taqman探針型定量。
4度保存1個月;-20℃保存1年。
一步法 RT-PCR 將 RNA 反轉錄合成 cDNA、目標 cDNA 的 PCR 反應合二為一。以下反應舉例為 50 μl 標準一步法RT-PCR 體系, 僅供參考。實際 RT-PCR 條件應根據模板、引物、目的片段大小加以優化,確定最佳反應條件。
1.在無RNase A污染的PCR管中配制如下混合液
Component | Volume | Final Concentration |
RT-qPCR 2×SuperMix(Taqman) | 25μl | 1× |
Forward Primer(10μM) | 1.5μl | 0.3μM |
Reverse Primer(10μM) | 1.5μl | 0.3μM |
Taqman探針(10μM) | 0.5-1.0μl | 0.1-0.2μM |
RNA Template* | Variable | as required |
dd H2O | Variable | - |
Total volume | 50μl | - |
* Total RNA 的使用量一般為 10 ng~1 μg;mRNA 的使用量一般為 1ng~1 μg
反應體系中各成分的量可根據以下原則自行調整:
l Taqman探針的濃度一般在0.05-0.2μM,可能需根據擴增基因和探針的不同而進行濃度優化。
l 一般來說反應體系中引物終濃度為0.2 μM即可得到較好的擴增效果。當反應性能比較差時,可以在終濃度0.1 - 1.0 μM范圍內調整引物濃度。
2.按下列條件進行qPCR反應
(1)常規擴增條件
50℃ | 30min | 反轉錄 |
95℃ | 1 min | 預變性 |
95℃ | 5-10 sec | 循環擴增 30-40 Cycles |
50~60℃ | 15 sec | |
72℃ | 15 sec | |
72℃ | 1 min |
(2)退火延伸一步法擴增條件
50℃ | 30min | 反轉錄 |
95℃ | 1 min | 預變性 |
95℃ | 5-10 sec | 循環擴增 30-40 Cycles |
60-68℃ | 30 sec | |
72℃ | 1min |
注意事項
l 本反轉錄反應條件適合絕大多數RNA,如RNA模板結構復雜,可將反轉錄溫度提高到55度,以提高反轉錄效果。
l PCR階段常規變性時間選擇10 sec;快速變性時間最短可選5 sec。
l 常規擴增條件的退火溫度可以根據引物的Tm值進行調整,當Tm較高時可以提高退火溫度,增加擴增條帶的特異性。
l (1)常規擴增條件下,200-300 bp片段延伸時間72度15 sec,200 bp以內片段72度10 sec;(2)退火延伸一步法擴增條件下,200-300 bp片段延伸時間60度30 sec;200 bp以內片段延伸時間60度20 sec。
l 退火延伸一步法擴增條件下的引物Tm值需要高于延伸溫度3-5度。
儀器類型不同,融解曲線采集程序不盡相同,使用儀器默認融解曲線采集程序即可。
注意事項:
l 本品在4度避光保存1個月內穩定,盡量避免反復凍融,以免造成酶活下降。如每次使用量較少,推薦小份分裝使用。
l 使用前請上下顛倒以混勻Master Mix,短暫低速離心后即可使用。請勿vortex避免酶失活,影響定量結果。
l 加樣過程中輕柔吹打,如果操作不慎導致SuperMix起泡,需離心方可使用。
l 本品使用時額外加入的Taqman熒光探針需避光,因此配制反應體系時應盡量避免強光照射。
l 為了防止環境DNA的污染,反應體系配制時請于超凈工作臺內進行,配制過程中請使用滅菌槍頭、反應管。
l 由于本品檢測靈敏度極高,易被空氣中氣溶膠污染。因此如經常檢測某些特定基因,為了避免氣溶膠污染,建議使用本公司的 UDG型 Taqman探針型一步法RT-qPCR 2×SuperMix (AQ0412系列)