T4 Rnl2tr K227Q是T4 RNA連接酶2截短型的K227Q突變體。K227的突變降低了賴氨酰腺苷化。由于降低了T4 Rnl2tr從接頭將腺苷基團轉移到RNA 5′磷酸基的活性,K227Q可以減少T4 Rnl2tr 非特異性的連接(串聯體和環)。
因為不再使用ATP,而改用預腺苷化接頭,同時降低賴氨酰腺苷化酶的活性,所以連接反應的背景可以降至最低。該酶已用于二代測序Small RNA的文庫構建中,優化了接頭的連接過程。
本公司T4 RNA 連接酶2,截短型K227Q是重組表達,并經多步純化制備的重組蛋白。
活性定義
200活性單位指在25℃,1×T4 RNA連接酶反應緩沖體系(20ul),60 min內將80%的31-mer RNA(5′-FAM-rArGrUrCrGrUrArGrCrCrUrUrUrArUrCrCrGrArGrArUrUrCrArGrCrArArUrA-3′ )連接到預腺苷化的miRNA通用克隆接頭17-mer DNA(5′-rAppCTGTAGGCACCATCAAT–NH2-3′,14μM)末端所需的酶量。
活性測定條件
1× T4 RNA連接酶2反應緩沖液:50 mM Tris-HCl (pH7.5 @ 25℃),10 mM MgCl2,1 mM DTT,10% (w/v) PEG 8000, 20 pmol of 5′-FAM-RNA, 40 pmol 預腺苷化DNA,25℃溫育60min。
濃度:200U/μl
保存條件:-20℃可保存2年,避免反復凍融
特點與適用范圍
? 將預腺苷化的DNA或RNA序列標簽連接到任何RNA 3′末端
? 將單鏈腺苷化引物連接至小RNA上,用于cDNA文庫構建
? 將單鏈腺苷化引物連接至RNA上,用于鏈特異cDNA文庫構建
產品包裝規格及組成
Component | AE1354A | AE1354B |
T4 RNA連接酶2,截短型K227Q | 2000U | 10kU |
10× T4 RNA連接酶2 Buffer | 0.2ml | 1.0ml |
50% PEG8000 | 0.2ml | 1.0ml |
質量控制
相關測試表明無外源單鏈和雙鏈 DNA 核酸內切酶、外切酶、 RNase 以及磷酸酶的污染。PCR方法檢測無宿主殘余DNA。
酶貯存緩沖液
10 mM Tris-HCl,100 mM NaCl,1 mM DTT,0.1 mM EDTA,50% Glycerol,pH 7.5 @ 25°C
使用實例:3′ OH of RNA和5′預腺苷化DNA linker連接反應
1)按下表配制反應體系
反應組分 | 體積或濃度 |
10×T4 RNA連接酶2 Buffer | 2ul |
RNA底物(10μM) | 2ul |
5′預腺苷化DNA linker(20μM) | 2ul |
50% PEG8000* | 4ul |
酶(200 U/μl) | 1-2ul |
無核酸酶H2O | Yul |
總體積 | 20ul |
2)25℃×1-2h反應,
3)添加蛋白酶K或終濃度20mM EDTA失活酶,
4)尿素變性PAGE電泳檢測酶切產物,或按實驗目的進行后續操作。
* 為了提高連接效率,PEG8000 濃度可以高達25%
警告: 本產品僅限科研實驗使用,臨床應用安全性和有效性未鑒定,不可用于醫療臨床診斷。
注意事項
l 熱失活:65℃溫育20分鐘。
l 可加入核酸酶抑制劑防止RNA污染。